兩岸人員往來從唯一的港澳中轉，因兩岸周末包機加入而打破后，將再因新辟臺灣－金門－廈門－大陸城市這條新路線，掀起另一波的競爭情勢，尤其經小三通到廈門轉運的票價最低，對港澳中轉大陸市場的威脅最大。 

    據臺媒分析報道，在兩岸沒有通航前，所有往返兩岸的旅客都得經港澳中轉，使得飛航港澳與接續(xù)后段至大陸城市的航空公司，每年都坐享厚利，為打破港澳線壟斷兩岸市場，遠東航空全力開辟中轉韓國濟州航線，后來搶下不少客運量。 

    遠航今年初爆發(fā)財務危機無法繼續(xù)經營，接著兩岸又開通周末包機航線下，濟州島航線從5月起即勢微，“后起之秀”的金廈小三通航線，在今年6月中旬政府宣布全面開放，以及9月中旬再開放大陸民眾可經小三通來臺觀光后，小三通航線立刻成為日益萎縮的島內各航線，唯一成長的黃金航線。 

    在兩岸開辟周末包機時即悄悄布局兩岸市場的廈門航空，看好未來兩岸航運，大舉投資興建廈門五通港，今年8月31日開航，從金門到五通僅需30分鐘航程，較金門至東渡碼頭70分鐘足足快了40分鐘，加上五通鄰近廈門高崎機場，對轉運的旅客而言相當便利。 

    尤其目前金廈小三通旅客量與日俱增，身價水漲船高，在連續(xù)假期與臺風過后，船位都被船公司所掌控，優(yōu)先安排給團客與有關系的旅客，很多獨自往來兩岸的臺商或到大陸自由行的旅客，只要遇到狀況，就很難拿到船位。 

    據了解，有些臺商曾在臺風過后，在廈門東渡碼頭苦等兩天仍排不到船位，干脆改搭廈門到香港再轉臺灣的班機，或補位廈門到松山的周末包機返臺，許多臺商氣憤的大罵船公司，并揚言不再走東渡碼頭往來兩岸。 

    看準小三通旅運需求，由廈航主導的水頭－五通航線，計劃未來從每天兩班增加至六班，屆時不單獨霸的港澳線會受到影響，開辟六年多的金廈小三通的廈門東渡碼頭，旅運量更會直接受到沖擊，使得兩岸航運市場重新洗牌。