大陸海峽兩岸關(guān)系協(xié)會(huì)與臺(tái)灣海峽交流基金會(huì)十年后復(fù)談，簽訂了有關(guān)大陸居民赴臺(tái)旅游及兩岸周末包機(jī)的兩份協(xié)議，被視為兩岸關(guān)系修好的表現(xiàn)。而一直擔(dān)任兩岸客貨運(yùn)航班中轉(zhuǎn)站的香港，則將不可避免地受到經(jīng)濟(jì)上的影響。 

　　香港在兩岸經(jīng)貿(mào)往來中一向扮演重要角色。據(jù)香港貿(mào)易發(fā)展局（下稱香港貿(mào)發(fā)局）的統(tǒng)計(jì)，目前活躍在香港的臺(tái)商大概有5000家。他們透過香港成立的公司作平臺(tái)，管理大陸生產(chǎn)基地的融資、采購(gòu)、營(yíng)銷等事務(wù)。還有不少臺(tái)商將公司總部設(shè)在香港，作為其整個(gè)大中華地區(qū)業(yè)務(wù)的指揮站。 

　　更重要的是，按照臺(tái)灣當(dāng)局對(duì)兩岸貿(mào)易的規(guī)定，所有貨品必須經(jīng)第三區(qū)運(yùn)輸，由于香港是主要國(guó)際貿(mào)易中心，又毗鄰廣東的制造業(yè)生產(chǎn)基地，在兩岸經(jīng)貿(mào)愈來愈頻繁的前提下，經(jīng)香港轉(zhuǎn)口的貨運(yùn)量一直增長(zhǎng)強(qiáng)勁。以貿(mào)易金額計(jì)，1997年僅115億美元，至2007年已躍升至241億美元，占香港貿(mào)易總額的3.4%。 

　　香港貿(mào)發(fā)局副首席經(jīng)濟(jì)師邱麗萍分析指出，按照目前情況估計(jì)，兩岸經(jīng)貿(mào)交易中，大概20%經(jīng)香港轉(zhuǎn)運(yùn)的貨物將因直航而流失，涉及金額約為48億美元。不過她認(rèn)為，因?yàn)橄愀叟徶槿堑貐^(qū)，不少貨物是通過陸路和水路運(yùn)輸，兩岸航空聯(lián)系并不會(huì)構(gòu)成非常沉重的影響。 

　　她補(bǔ)充說，由于香港擁有優(yōu)良的配套，如保安、法制等，加上成熟的分銷平臺(tái)，臺(tái)灣的產(chǎn)品以高附加值的電子類產(chǎn)品為主，故不少臺(tái)商選擇先把貨物存放在香港待銷，或在香港作進(jìn)一步的測(cè)試和處理。以此推斷，仍有80%的貨運(yùn)量將仍以香港為轉(zhuǎn)口地。 

　　香港貿(mào)發(fā)局還估計(jì)，兩岸實(shí)施的周末包機(jī)對(duì)旅游業(yè)方面的影響較為輕微。過去大部分往返大陸的臺(tái)灣游客，都以香港為過境點(diǎn)，但正因如此，他們?cè)谙愀鄣南M(fèi)一般不高，據(jù)香港旅游發(fā)展局的統(tǒng)計(jì)，人均消費(fèi)僅1239港元。 

　　按照2007年的統(tǒng)計(jì)數(shù)字，訪港的220萬人次臺(tái)客中，90%是前往內(nèi)地。盡管日后轉(zhuǎn)機(jī)旅客改乘兩岸直航包機(jī)，但往來珠三角的臺(tái)胞應(yīng)不會(huì)受影響。因?yàn)楦叟_(tái)航班較繁密，香港鄰近珠三角地區(qū)，以陸路和水路往來十分方便。香港貿(mào)發(fā)局因此相信，香港作為中轉(zhuǎn)站較內(nèi)地其它城市有競(jìng)爭(zhēng)力。邱麗萍預(yù)期，只有5%的人次會(huì)因直航而流失，經(jīng)濟(jì)收益的損失約1.36億港元。 

　　香港商務(wù)及經(jīng)濟(jì)發(fā)展局局長(zhǎng)馬時(shí)亨早前也曾表示，兩岸直航短期內(nèi)對(duì)香港航空或旅游業(yè)會(huì)有少許影響，但整體而言，“三通”改善政治環(huán)境及經(jīng)濟(jì)交往，對(duì)整個(gè)區(qū)域經(jīng)濟(jì)是好事，整體對(duì)香港經(jīng)貿(mào)及金融等各方面的發(fā)展會(huì)帶來好處。 

　　不過，香港臺(tái)灣工商協(xié)會(huì)會(huì)長(zhǎng)江素惠指出，港府不應(yīng)對(duì)直航的影響過于樂觀。她向《財(cái)經(jīng)》記者表示，要切實(shí)思考彌補(bǔ)損失的方法，消除香港市民的憂慮，例如如何吸引更多臺(tái)灣旅客到港旅游消費(fèi)，加強(qiáng)本土競(jìng)爭(zhēng)力等。